1。機器の検出フラックス
最初に考慮すべきことは、ラボが定量PCR装置を使用する必要がある頻度です。カリフォルニア大学サンフランシスコがんセンターのゲノム解析装置の責任者であるDavidGinzingerは、市場に出回っているほとんどの定量PCR装置をテストしました。彼は、それが大規模に使用されない場合、例えば、それが主に既知の遺伝子をテストするために使用される場合、それは高価なハイエンド製品を必要としないと言いました。しかし、新薬の標的や疾患マーカーを見つける必要のある研究所では、384ウェルプレートを保持してより高速に動作できる機器が必要です。ただし、このようなハイスループット機器だけでは十分な速度が得られず、サンプル前処理がレート制限のボトルネックになることがわかります。したがって、ハイスループットラボでは、さらに自動化された機器が必要になることがよくあります。ボタンが押されている限り、機器は自動的にサンプルを処理し、核酸を精製し、PCRテンプレートを準備します。
2.複数の増幅の能力
複数の増幅が熱くなっています。リアルタイム定量PCR装置は免疫がありません。ハイエンドの定量PCR装置には複数の検出チャネルがあるため、装置は同じサンプルタンク内の複数のテンプレートの増幅プロセスを検出できます。新しいLightCycler2.0には6つの検出チャネルがあり、元のチャネルより3つ多くなっています。 SmartCyclerⅡには4つの検出チャネルがあります。ライブラリ製品で有名なStratageneには、Rocheの半分以下の価格で4つの検出チャネルという評判の高い定量PCR装置Mx3000Pもあります。ただし、複数の増幅は実験を複雑にするため、すべての人に適しているわけではありません。
3.ソフトウェア
定量PCR装置を選択する準備ができたら、付属のソフトウェアを確認する必要があります。使い勝手が良いですか、必要な分析を実行できますか、いくつかの出力形式があります。ただし、使いやすいソフトウェアは機能が比較的単純で、複雑な計算ができないかどうかに注意する必要があります。以前のソフトウェアでは、さらに分析を行う必要があります。新しいソフトウェアはすでにすべてを処理できます。基本的な機能に加えて、一部のソフトウェアには、プライマーとプローブの設計、複数の分析の設計、バックグラウンド補正、データの正規化など、より多くの機能を含めることもできます。 Rocheの応用科学部門のアプリケーションおよび技術サービス部門の責任者であるWillianDemyanは、定量PCRは幾何学的増幅のプロセスであると強調しました。最初はコピーの違いがあり、結果は幾何学的な順序によって異なります。
4.柔軟性
大規模で忙しい実験装置は確かにうらやましいです、そして従来の実験室も素晴らしい選択をすることができます。現在のサプライヤーには、現在のニーズを理解するだけでなく、さまざまなアップグレード可能なアクセサリやモジュールの提供など、将来の需要の変化を検討するための多くの技術専門家がいます。 BioRadのMyCyclerは、モジュールを選択し、リアルタイム定量にアップグレードできます。 ABIの定量PCR装置には、さまざまなサンプルタンクがあり、96ウェルタンクをダブル384ウェルタンクに変更して、高スループットの要件を満たすことができます。少量でqPCRを開始したばかりのラボでは、SmartCyclerII定量PCR装置が適しています。基本モジュールには16個の独立した温度制御サンプルタンクがあり、16個の完全に独立した異なる実験を同時にまたは前後に実行できます。 "アクセス";実験室がより大規模な実験を必要とする場合、96サンプルウェルである1から6の基本モジュールに非常に経済的にアップグレードできます。 96ウェルプレートは使用できませんが、学生が少量の実験を開始する場合、他の学生もいつでもプラグインして独自の実験を開始でき、相互に干渉しないため、柔軟性が向上します。これは、実験の数が少なく、最初は予算が限られているラボにとって非常に柔軟なオプションです。
5.不確実性
ソフトウェアは部分的に修正することができますが、計算よりも多くの計算修正を必要とせずに、体系的なエラーの少ない機器を購入することをお勧めします。 Cinzingerは、機器のサンプルウェル間の違いに特別な注意を払う必要があると考えています。サンプルホール間のよく知られた温度差に加えて、サンプルホールと検出プローブの間の光路距離にもわずかな違いがあり、信号の送受信に関与するファイバの長さにはわずかな違いがあります。 、レンズとサンプル穴の間の距離と角度のわずかな違い、さらには信号伝送に対するサンプルセルの影響。 Cinzingerは、市販されているほとんどの定量PCR装置で同じテストを実施しました。彼は、機器の各ウェルで同じサンプルと試薬をリアルタイムで増幅します。残念ながら、多くの場合、異なるサンプルウェル間で異なる結果が得られます。
6.キットの選択
営業スタッフは優れた品質管理キットを誇り、ソリューションは1対1の結果をもたらしますが、既製のキットを購入することは違いの解決策ではありません。真剣な評価実験と分析実験が解決策です。
